Najbardziej nieekonomicznym etapem procesu jest oczyszczanie cząsteczek MHC. Chromatografia powinowactwa z przeciwciałami anty-MHC jest jedynym sposobem postępowania i nie odzyskuje więcej niż 50% docelowych cząsteczek. Ponadto niektóre peptydy zostaną utracone podczas procedury, ponieważ mają niskie lub średnie powinowactwo do MHC lub mają sekwencje hydrofobowe, które sprzyjają wymianie w obecności detergentów. Końcowy etap, obejmujący kapilarną chromatografię cieczową, a następnie spektrometrię masową (6), również prowadzi do pewnego ścierania, ponieważ niektóre peptydy zostaną utracone lub słabo oddzielone przez chromatografię lub niezjonizowane właściwie w komorze spektrometru masowego. Chociaż teoretyczne i czasami praktyczne granice wykrywania spektrometrii mas osiągnęły zasięg femtomolowy, w przypadkach takich jak niniejszy, w których materiał wyjściowy jest wysoce niejednorodny i pożądana jest jednoznaczna informacja o sekwencji, wymagane są znacznie wyższe stężenia, aby umożliwić powtórne pobieranie próbek. i ostateczne identyfikacje. Tę serię ograniczeń można zrekompensować jedynie poprzez zwiększenie ilości materiału wyjściowego, którą Wahlström i in. kończyć. Zastosowanie takiego podejścia byłoby trudne do przewidzenia w przypadku badania tkanki trzustki od pacjentów z cukrzycą lub ciałem z chorobą wywołaną przez układ odpornościowy u osób z łuszczycą, ale mogło być przeprowadzone u osób z reumatoidalnym zapaleniem stawów za pomocą komórek pannus izolowanych od pacjentów poddawanych leczeniu Chirurgia. Pomimo tych wyzwań, w swoim obecnym raporcie Wahlström i in. wykorzystali tę technikę do identyfikacji niektórych dobrze znanych autoantygenów w płynie BAL u pacjentów z sarkoidozą, takich jak wimentyna, syntaza lizyl-tRNA, i. aktyny, ale wyniki nie ujawniły nowych potencjalnych kandydatów, które mogłyby być swoistym celem odpowiedzi autoimmunologicznej w sarkoidozie. Algorytmy predykcyjne dla wiązania MHC można zastosować w celu zapewnienia wskazania, że peptydy zidentyfikowane technikami oczyszczania MHC / spektrometrii mas faktycznie wiążą interesujący HLA, ale ostateczne potwierdzenie może pochodzić tylko z bezpośrednich badań wiązania z oczyszczonymi cząsteczkami MHC. Ostatecznie seria peptydów oczyszczonych z płynu BAL będzie musiała być przetestowana pod kątem ich zdolności do stymulacji komórek T dodatnich pod względem AV2S3 obecnych w płucach pacjentów z sarkoidozą. Badania te mogą bardzo dobrze ujawnić, że jeden z peptydów zidentyfikowany w niniejszym badaniu napędza odpowiedź autoimmunologiczną w sarkoidozie i jako taki może być celem dla interwencji immunologicznej. Sekwencje flankujące zmieniają przetwarzanie epitopów HIV Raport Le Gall et al. (7), również w tym wydaniu JCI, który bada przetwarzanie i prezentację peptydów HIV w celu rozpoznania MHC klasy I, nie przedstawiał technicznych trudności Wahlström i wsp.
[więcej w: po której stronie jest serce, animusz rzeszów, kali sentymentalnie chomikuj ]
Comments are closed.
Jak się ma zapalenie oskrzeli to trzeba leżeć cały czas w łóżku ?
[..] Oznaczono ponizsze tresci z artykulu oryginalnego: dentysta Warszawa Wola[…]
Zapalenie oskrzeli mam co najmniej 2 razy w roku
Article marked with the noticed of: kulturystyka[…]
Polecono mi fototerapię
Article marked with the noticed of: restauracje katowice[…]
Mi tez pomagał przy zakwasach po ćwiczeniach